• Od pytania klinicznego do właściwej próbki

    Jak przełożyć decyzję kliniczną, lokalizację zakażenia i fazę choroby na wybór reprezentatywnego materiału, analitu oraz metody mikrobiologicznej.

  • Pobieranie, transport i przechowywanie materiału

    Jak objętość, aseptyka, podłoże, atmosfera, temperatura, czas i opakowanie zachowują tożsamość, integralność oraz bezpieczeństwo próbki mikrobiologicznej.

  • Kontaminacja próbki a rzeczywiste zakażenie

    Jak odróżniać zakażenie, kolonizację i kontaminację na podstawie miejsca pobrania, niezależnych próbek, ilości sygnału, gospodarza, kontroli oraz wzorca całego procesu.

  • Mikroskopia i barwienie w diagnostyce

    Od rozdzielczości, kontrastu i preparatyki przez barwienia Grama, kwasooporne, grzybicze i Giemsy po czułość, artefakty, kontrolę jakości oraz bezpieczne raportowanie obrazu.

  • Posiew, kultura czysta i identyfikacja fenotypowa

    Jak podłoże, sposób posiewu, atmosfera i inkubacja selekcjonują wzrost oraz jak przejść od kolonii przez kulturę czystą do ostrożnej identyfikacji fenotypowej.

  • PCR, qPCR i diagnostyka syndromowa

    Od cyklicznej amplifikacji, starterów i sond przez Cq, ekstrakcję oraz kontrolę inhibicji po korzyści i pułapki wielocelowych paneli syndromowych.

  • Czułość analityczna, kliniczna, swoistość i wartość predykcyjna

    Jak odróżniać LoD od czułości klinicznej, zbudować tabelę 2×2, obliczać PPV, NPV i ilorazy wiarygodności oraz oceniać próg, ROC, bias i użyteczność testu.