• Gleba jako siedlisko mikroorganizmów

    Gleba jako porowaty, wielofazowy reaktor: agregaty, filmy wodne, mikrostrefy tlenowe i beztlenowe, materia organiczna, sieć troficzna oraz właściwe metody próbkowania.

  • Wody słodkie, osady i strefy redoks

    Jeziora, rzeki i osady jako układy transportu i reakcji: stratyfikacja, tlen, pionowe strefy redoks, materia organiczna, strefa hyporeiczna oraz metody pomiaru.

  • Ocean, pętla mikrobiologiczna i produkcja pierwotna

    Mikrobiologiczny obieg materii w oceanie: produkcja pierwotna, DOM i pętla mikrobiologiczna, wirusy, marine snow, pompa biologiczna oraz życie głębinowe.